15 年前
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小智（松本梨花 配音）带着皮卡丘（大谷育江 配音），和同伴们继续前行在冒险的旅途之中。路上，一行人遇见了带着神奇宝贝胡巴（钉宫理惠 配音）的少女麦亚丽（中川翔子 配音）。胡巴能够制造出神奇的时空圆环，带领大家在不同的地点来回穿梭。
地处沙漠腹地的城市迪赛鲁西坦到了，曾经，在这里发生过一场声势浩大的神奇宝贝战争，亦是因为这场战争，这里才成为了干涸少水的沙漠。在这里，麦亚丽和哥哥巴尔扎（藤原龙也 配音）汇合了，让大家没有想到的是，巴尔扎竟然得到了封印着可怕神奇怪手的瓶子。在误打误撞之中，封印被解开了，那个曾经终结过迪赛鲁西坦的可怕怪兽重见天日，而它的真实身份，竟然是超胡巴（山寺宏一 配音）。。均昊（明道 饰）收购观美渔村改建成新的观光景点偕同未婚妻芸熙（赵虹乔 饰）前往，偶遇专门欺骗观光客的天瑜（陈乔恩 饰），两人就此种下结子。均昊买给芸熙的求婚戒指不幸遗失，意外被去参加抬神轿比赛的芸熙捡到，均昊便认定她是个爱钱的女骗子。
均昊的好友子骞（王绍伟 饰）一直爱着芸熙，他的拜把朋友为了帮他夺回最爱，在芸熙和均昊订婚当天绑走均昊，导致两人坠海。均昊爬上岸求救，却被天瑜一家人撞上。均昊清醒后失去记忆，天瑜一家连合骗他为大陆偷渡客，并为他取名为茼蒿，留在杂货店工作。在纯朴的渔村生活下，均昊的个性有了一百八十度的大转变，不知不觉中对天瑜和均昊产生情愫。就在两情相悦时，均昊的记忆渐渐恢复了，忘记了与天瑜的记忆，准备与芸熙结婚。而天瑜该如何唤醒均昊爱的记忆，抢救与均昊之间的爱情呢？。