16 年前
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从小，安琪莉可（远藤绫配音）的梦想就是能够成为一名医生，给需要帮助的患者带来健康和希望，即便是父母被魔兽袭击身亡也没能够改变安琪莉可坚定的决心。一次偶然中，在医院工作的安琪莉可发现自己拥有能够净化魔物的神奇能力，在周遭同伴的鼓励和支持下，她毅然决然的加入了名为Aube Hunte的组织，踏上了一条充满了危险和争斗的道路。 在净化魔物的旅途中，安琪莉可结识了直率坦诚的雷因（高桥广树配音），稳重可靠的尼克斯（大川透配音），温柔善良的杰德（小野坂昌也配音），忠心耿耿的修迦（小野大辅配音）等人，在他们的帮助和保护下，安琪莉可逐渐成长成为了可以完全消灭魔物的女王。。在不久的未来，世界已经被智脑公司所统治。
世界上的大多数人类都被智脑公司变成了怪人“俄尔以诺”，残存下来的人类仅有2433人，他们组成反抗军，以女主角园田真理为中心，躲在角落里苟延残喘。
而假面骑士555是人类的救世主，其变身者乾巧，在智脑公司发动的总攻下被打败，目前生死不明。
智脑公司为了对付余下的假面骑士凯撒，开发出了最强的假面骑士腰带“帝王腰带”。面对利用帝王腰带变身的强大邪恶假面骑士，反抗军无力对抗。难道人类真的就要就此灭绝了吗？
心灰意冷的园田真理在空无一人的舞会上独自落泪，就在这时她的背后出现了一个一身白衣的男子，真理从他身上隐约看到了乾巧的影子。没错，他就是丧失了记忆的乾巧。
巧和真理的命运在这孤独的世界中会走向何方？人类的救世主传说就此展开！。