17 年前
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位于东京的东都线地铁开通当日，一起针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击事件爆发，导致东都线列车损毁。经过一番推理，江户川柯南等人认定这次的事件与8年前朝仓优一郎主持负责的北之泽水坝的修建有关。
当年为了修建大坝，朝仓动员北之泽村的人民搬入新村，可是仍有许多人反抗到最后阶段不愿搬迁。为了探明事情的真相，柯南、灰原、少年侦探团以及毛利小五郎等人开车前往白雪皑皑的北之泽。在这片纯净的雪国，少年们尽情玩耍，与此同时他们也遇到了几名原北之泽村的村民，山尾、远野、立原等人。他们是从小一起长大的好朋友，而彼此之间似乎又有着某种芥蒂和秘密。
立原的儿子冬马在8年前坠崖，在这8年时间里他一直昏迷不醒。在母亲的照料下冬马终于醒了过来，但却丧失了记忆，不知道当时在自己身上发生了什么事情。柯南通过推理，认为冬马的坠崖与一系列的案件有关。。以2009年11月在日本真实成立的警视厅“特别搜查对策室”为舞台背景的故事借由该团队的新人樱木泉（上户彩 饰）之眼展开。
任职于特别搜查对策室的樱木泉是个热血又执着的好青年，颇具正义感的她无法放任不公平和悬而未决的事情发生。而对策室则是汇聚各类精英的地方，泉的直属上司长岛秀夫（北大路欣也 饰）就是警视厅响当当的人物之一。除了优秀的团队外，对策室还有最尖端的技术设备，像是利用DNA来鉴别凶手等。这样的对策室把视线放在了那些未决的事件之上，集中精力调查棘手事件，只为寻求真相，还被害者一个公道，这就是对策室的目标。紧张又刺激的故事就此展开……。《大云寺地宫密码》是以泾川县大云寺遗址先后三次出土佛舍利为主线摄制的一部大型纪录片。。