23 年前
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军方和汽车人的秘密合作计划面临被取消的危险，而重新复活的威震天和红蜘蛛引领霸天虎军队，密谋夺取能量源，企图在地球掀起又一场腥风血雨。
此时主人公山姆告别相恋的女友米凯拉，要开始自己梦寐以求的大学生活了，但一切似乎都不那么顺利，一块小小的魔方碎片似乎在给予山姆某种启示。为了获取魔方里的信息，霸天虎开始了对山姆的追击，擎天柱为了保护山姆而牺牲，山姆受其感召，决定重新担负起自己的使命。
山姆在自己室友里奥和“机器战士”西蒙斯的帮助下来到了埃及，他们在金字塔里发现了能量源。而此时，霸天虎的军队也赶到了埃及。军方此时有一小队人马也在西荤斯的要求下带着擎天柱的尸体来到了埃及，善恶双方力量在那片金色的沙漠展开了殊死搏斗。。童年的江小艾在一场车祸中目睹了母亲的去世从而在心中蒙上了一层阴影。小艾的爸爸为了让女儿走出阴影想方设法给她编织了一个魔法故事，小艾在这个魔法故事中逐渐长大，确实走出了童年的阴影，但是又变成了一个深度中二病患者…。